Το Ιστορικό Μουσείο του Ηρακλείου βρίσκεται στη βόρεια πλευρά της πόλης. Στεγάζεται σε νεοκλασικό κτήριο και στις αίθουσές του εκτίθενται δημιουργήματα των Βυζαντινών, των Μεσαιωνικών και των νεώτερων χρόνων. Ιδιαίτερη θέση έχουν έργα του λαϊκού κρητικού πολιτισμού, αγιογραφίες και εικόνες της Κρητικής Σχολής. Μία αίθουσα είναι αφιερωμένη σε παραδοσιακό κρητικό σπίτι και δύο αίθουσες φιλοξενούν ενθυμήματα του μεγάλου συγγραφέα Νίκου Καζαντζάκη. Σε ειδικό χώρο εκτίθεται ένα από τα έργα του κορυφαίου κρητικού ζωγράφου Δομήνικου Θεοτοκόπουλου.