Στα νότια της Λότζιας βρίσκεται η Βασιλική του Αγ. Μάρκου, η οποία χτίστηκε (όπως και τα άλλα κτήρια της πλατείας) σε μικρογραφία της κεντρικής πλατείας της Βενετίας. Ήταν αφιερωμένη στον προστάτη άγιο των Βενετών, τον ’γιο Μάρκο. Η Βασιλική ανήκε στον Προβλεπτή Κρήτης (Γενικό Διοικητή) και εκεί θάβονταν οι προβλεπτές. Κατά την Τουρκοκρατία μετατράπηκε σε τζαμί.